Leukemia limfoblastik akut (ALL) merupakan kanser kanak-kanak yang paling biasa, dan kemajuan dalam rawatan telah meningkatkan daya tahan hidup dengan ketara. Walau bagaimanapun, 5–15% kanak-kanak masih kambuh, dan kambuh kekal sebagai punca utama kematian. Stratifikasi risiko sedia ada—sebahagian besarnya berdasarkan pembolehubah klinikal dan keabnormalan genetik klasik—telah meningkatkan hasil tetapi masih tidak cukup tepat untuk mengenal pasti, semasa diagnosis, kanak-kanak mana yang berisiko tinggi.
Projek ini menangani jurang tersebut dengan memanfaatkan kerjasama unik yang telah lama terjalin dengan Universiti Nasional Singapura (NUS), yang diketuai oleh Prof Hany dengan kerjasama Profesor Allen Yeoh (NUS). Selama lebih dua dekad, kerjasama ini telah menghasilkan repositori berharga data beranotasi klinikal dan penjujukan RNA daripada pesakit ALL sel-B pediatrik.
Objektif terasnya adalah untuk meningkatkan stratifikasi risiko klinikal sedia ada dengan menggabungkan konteks transkriptomik, membolehkan ramalan risiko kambuh yang lebih bermaklumat secara biologi pada pembentangan pertama. Set data yang mempunyai anotasi klinikal yang baik dari pelbagai pusat di Malaysia dan Singapura dikurasi dan diselaraskan, mengintegrasikan pembolehubah klinikal dengan data penjujukan RNA dimensi tinggi untuk menyokong pemodelan ketepatan.
Memandangkan skala dan kerumitan set data ini, projek ini menggunakan strategi analisis yang disesuaikan, termasuk pemilihan ciri menggunakan analisis gen pembezaan dan peringkat laluan, di samping pelbagai pendekatan pemodelan seperti analisis masa-ke-peristiwa. Kohort luaran digunakan untuk menyokong pengesahan model. Secara selari, penerbitan yang timbul daripada tinjauan literatur naratif telah memainkan peranan penting dalam mengkontekstualisasikan kerangka biologi yang menyokong kajian ini, sementara penemuan analisis akhir disatukan dalam manuskrip berasingan.
Selain output saintifik, projek ini memberikan pembinaan kapasiti yang kukuh melalui kerjasama berstruktur dengan Prof Wong Limsoon, Profesor dan Pengerusi di Sekolah Pengkomputeran di Universiti Kebangsaan Singapura (NUS), dan bimbingan semasa penempatan Dr Oh di NUS. Penglibatan awal dengan kolaborator di Universiti Cambridge meletakkan kerja untuk peluasan ke dalam analisis sel tunggal.
Akhirnya, projek ini bertujuan untuk menyokong keputusan rawatan yang lebih awal dan lebih tepat, membantu doktor menentukan—semasa diagnosis—sama ada kanak-kanak berkemungkinan sembuh atau berisiko kambuh, sekali gus memajukan terapi yang lebih selamat dan lebih diperibadikan untuk kanak-kanak dengan ALL.
